面对一个个错综复杂的悬疑案件，法证部高级化验师余星柏（黄宗泽 饰）、重案组高级督察井浩然（袁伟豪 饰）、法医科高级医生范佩清（蔡洁 饰）三人团将如何一步步抽丝剥茧，在危机四伏的谜团中，用科学揭露事实寻觅真相？在面临生死时，他们又将如何坚守本心，完成对自我和他人的救赎？一切答案都将在本季剧集中揭晓。
北宋末年，奸臣当道，民不聊生。曾为神捕司统领的诸葛正我（林嘉华饰）是朝廷中的正义力量，却多年郁郁不得志。他希望能重掌神捕司儆恶惩奸以整顿法纪，于是他召集天下英才伸张正义，组成各怀绝技的“武林四大名捕”：被誉为“暗器之王”而独步天下的大师兄无情（林峰饰），积恶扬善练就一双铁掌的二师兄铁手（马国明饰），放浪不羁游戏江湖的三师兄追命（陈键锋饰）腿功惊人，追踪术无人能及，以及看似冷酷实则重情重义，练就一剑封喉绝技的四师弟冷血（吴卓羲饰）。在诸葛正我的带领下，四大捕快为民请命，破案无数，深得朝廷跟百姓的赞颂。从此江湖人称“四大名捕”。本片改编自温瑞安武侠经典作品《四大名捕》。
湘西农家子弟狄云，自幼随师父铁锁横江戚长发和师妹戚芳习武务农。一天戚长发多年未见的师兄万震山派弟子来请戚长发去作客。三人到了万家。先是逢大盗吕通前来寻仇，狄云拼着受伤打退了吕通，却反而见疑于万家。先是万震山的八个弟子深夜寻衅，打了他一通。第二天他气不过他们的奚落嘲笑，用从一个老乞丐处学来的几招剑法回敬了其中几人。万震山疑心戚长发已学得师门不传之秘连城剑法又教给狄云，遂将戚长发诱入房中击杀，却又伪造现场反诬戚长发击伤了他而逃走，而已意犹未尽，复又设下圈套将见义勇为前往捉贼的狄云裁赃诬为强奸偷盗犯，打入死牢。万震山的儿子万圭假作好人，让戚芳以为他出钱出力想让狄云尽早出狱，其实却是买通官府将狄云轻罪重办。戚芳信以为真，又认定狄云确有其罪，虽然感情仍在，但对狄云也感到伤心和失望，终于嫁给了万圭。
宇文峰（郑少秋 饰）出身武当，勤学苦练，身手了得，学成下山后，宇文峰受到了当时最大的兵器工厂唐门的赏识，门主更是将女儿唐碧（汪明荃 饰）许配他。哪知道唐门突遭不幸，被诬陷勾结外族，落得满门抄斩的下场，而宇文峰则被打入大牢，即将问斩。太监张诚（陈鸿烈 饰）欣赏宇文峰的身手为人，以替他卖命作为条件，救下了宇文峰。那边厢，唐碧死里逃生，之后成为了京城第一大镖局的女当家，丈夫死后，唐碧接管了镖局，并且最终凭借她的智慧和能力获得了周围人的认可。宇文峰加入了锦衣卫，受张诚胁迫，干尽了伤天害理之事，一次偶然中，宇文峰和唐碧重逢了，一段旷世情缘再度拉开帷幕。
反黑组高级督察国锋（郭晋安 饰）为人正义、铁面无私，本来有一个其乐融融的家庭。不料却因整日忙于工作疏于照顾家庭而导致妻子阿玲和从美国回来的前男友阿John复合，离婚时国锋誓要取得儿子谦仔的抚养权。无奈下阿玲只得告知国锋真相，谦仔原来是她和前男友的儿子，于此同时谦仔得十分古怪的血液病，国锋无奈之下只好答应让谦仔跟阿John和阿玲移民美国去治病。国锋多年前曾亲手将自己的好友阿庭逮捕归案，阿庭别无所求，只求阿峰在他坐牢期间帮忙照顾他的女友阿兰（刘雅丽 饰）。阿兰经营着一间酒吧，由此经常有些麻烦，国锋次次都出面帮她解决。新调来的美女同事雅丽（袁洁莹 饰）误认为国锋因为阿兰才抛妻弃子，故对他一直看不顺眼。国锋的好友兼同事家荣（张家辉 饰）喜欢上了雅丽，三人在合作过程不时擦出火花。他们能否顺利处理好工作上、感情上的矛盾？
庄天（元华 饰）和董兆匡（张国强 饰）曾经是行业内最最有名的一堆捉妖天师，然而清末民初的一场社会大变革让捉妖师变成了宣扬封建迷信的神棍，无奈之下，两人只得前往广州，在那里寻得了一份警察的差事。虽然不再是捉妖师了，但董兆匡却依然忘记不了昔日的辉煌，他结识了商人阿堂（任世官 饰），阿堂表面上是经营正当生意的商人，实际上却干着贩毒的勾当，董兆匡听信了他的花言巧语，开始利用僵尸来帮助他运毒。董兆匡的徒弟晓东（陈晓东 饰）爱上了阿堂的女儿翠玲（谭小环 饰），然而董兆匡早已经开始打起了翠玲的主意。
添为裙褂店老板，对婚姻及裙褂店都有一分执著，即使妻子辞世多年，亦无再婚念头，直至遇上美。美是释囚，添因同情其遭遇，遂让美在其裙褂店里工作，更与美发展出一段黄婚恋。正因添对裙褂的一针一线都有感情，故不愿与师弟乐经营的婚纱店合作，抗拒将裙褂机械化、工业化，直至乐妻飞积极游说，才应允合作。添有一子一女，大女恩安于平淡的婚姻生活，察觉不到婚姻背后的暗涌，恩丈夫伟已厌倦工作和婚姻，遇上志趣相投的摄影助手岚，遂热烈追求岚，后更与恩弄致离婚收场。次子贤与仪相恋多年，合资买楼结婚，却遇上金融风暴，两口子经常为经济问题而争执，后仪更爱上勇，贤又与仪母发展暮水忘年恋，带出一段错综复杂的四角关系。伟兄乐经常周旋在前妻珊、妻子飞及情人慧之间，尽享齐人之福，直至生意失败，才发现一直支持自己的只有珊。恩之好友芝供男友坚到外国读书，可惜坚却见异思迁，追求大律师之女舒，芝经此一役，对爱情失去信心，后虽遇上三，但对三仍有戒心，幸三体谅芝，二人终于步入教堂。
汤逊投资有限公司董事长汤柏荣的女儿汤倩文从外国回港，发觉家中发生巨变，母亲神秘死亡，哥哥被判入狱，而家族生意的控制权则落入了一个与其父有着不寻常关系的女人周咏诗手上。倩文回港不久，险些遭人绑架，但由于犯罪集团的失误而逃过一劫，期间更与被卷入绑架案的小偷王志祥及的士司机叶启泰攀上关系。犯罪集团随即从外地聘请神偷冯永来港，与叶启泰及王志祥合作，计划盗走由汤逊投资有限公司承保，价值连城的古董。岂料倩文机警地设下圈套令冯永等三人自投罗网，卷入汤家的家产争夺战中。
O记沙展天宝（林宝怡 饰）在酒吧重遇了当日杀死妻子刑满释放的道友强，忍不住将打得他重伤入院。随后，城中富商纪中南（曾江 饰）的独子彦祖（马浚伟 饰）遭绑架，天宝在监视绑匪刘英勇的情妇石小玉时发现了他们收藏人质的地点，马上前往营救人质。匪徒在收到了赎金后得知了天宝正在前往营救人质，于是企图引爆炸弹将他和人质炸死，幸好天宝最后关头救出了彦祖。纪中南十分感激天宝，两人成了朋友。这日宝在差馆再遇道友强，借落口供又打了他一顿，岂料因此而被逼自动辞职。好友正杰（张兆辉 饰）邀请天宝加入自己的保安公司，但天宝觉得不合适拒绝了。随后，天宝想自己做生意却又处处碰壁。这天，纪中南想请保镖，正杰知道天宝和他的关系，于是请天宝前往纪中南处为自己的公司作推荐。
远离中原的蛇岛上，独龙尊者带着徒弟金世遗（林峰 饰）生活，将毕生绝学传授给他。一天毒龙尊者突然走火入魔而死，临死前吩咐金世遗带着亲笔书函回到中原交给邙山派掌门吕四娘。向来在孤岛长大不懂中原礼节的金世遗衣衫褴褛地踏上中原土地，被误认为是丐帮弟子卷入帮派纷争，出手不凡的他引起了邙山派女弟子谷之华（李彩桦 饰）的注意。而血滴子杀手厉胜男（叶璇 饰）也盯上了金世遗，更对他进行颠倒黑白的教育让他对付正派人士。在前去邙山的途中，金世遗与谷之华渐生情愫，然而厉胜男也对金世遗产生了微妙的女儿之情，这不能出口的爱意与自己特殊的身份令她喜怒无常，金世遗捉摸不透。随着门派纷争进一步扩大，金世遗与厉胜男、谷之华这两位绝代女子也经历了感情涤荡。
剧集以隐形任务战略部队及反恐特勤队作为剧集主题，讲述一众反恐精英与不法份子掀起连场激斗的故事。
「孝感动天」是以四个古代感人故事，来表彰百行以孝为先之美德。演员阵容鼎盛，剧情感人肺腑。缇萦救父──缇萦（蔡少芬）自幼与父（胡枫）相依为命，侍父至孝。后其父被诬害入狱，为救父她不惜滚针床、赤足踏火炭、饮毒酒、甚至代父受刑。她的孝义终感动皇上赦免其父之罪，并废残酷不仁之五刑。精忠旗──岳珂（魏骏杰）为岳飞之后，忠心爱国，并立志替先祖翻案雪耻，后取得证据可替岳飞翻案，但为顾全先皇颜面，终以鲜血毁证物。此举感动在任皇帝下旨恢复岳家名声，岳珂继祖志显孝，名留青史。目莲救母──目莲（叶蕴仪）自幼被遗，几经辛苦，寻获生母刘青提（魏秋桦），惜其母因杀人被判入狱，后得怪病而死，被困地狱。目莲为救母竟打破地狱门，舍身割肉喂鬼，令其母感动忏悔，令天地为开，修成正果。赵氏孤儿──赵武（罗嘉良）本为忠臣良将之后，因其父被奸臣所害，遭灭门惨变。武为忠仆程婴（刘江）所救并抚养成人，婴为助武诛仇人，更不惜牺牲自己。后武感念养父子之恩，以上卿身分将婴灵位奉养于赵家祠，孝顺之心可昭日月。
