与莉可、罗伊以及帕底亚地区的三只最初的宝可梦们一起踏上激动人心的宝可梦世界冒险之旅吧！
薄暮时分，江户城下，百物成妖，千妖成群。长崎屋少爷从小体弱多病，某日溜出门走夜路回家，不意撞上杀人凶手，卷入凶案，少爷当如何躲过劫难，妖怪们能否助少爷一臂之力，揭开案件真相……
妖精小姐迷上日本文化！？上班族北濑一广唯一的兴趣就是睡觉。他从小就在不可思议的梦中世界进行刺激的冒险。某次与在梦中结识的妖精一起冒险时，两人不幸被龙的吐息烧死。失败后，他一如往常于位在东京的房内醒来，却赫然发现妖精少女熟睡在身边
无比可爱的少女型兵器“阿尔玛”与将她制造出来的两位天才科学家带来的家庭情景喜剧！！少女型兵器阿尔玛直率的提问和分析把天才科学家们逗得团团转！？
憧憬成为帅气的大魔法使的赛特，为了打倒来自天空的怪物涅墨西斯，每天都在努力的进行魔法特训，但赛特的训练一直不顺利，总是引起纠纷给村子里的人添麻烦。某一日，巨型涅墨西斯袭击了村子，为了拯救世界彻底消除涅墨西斯，赛特下定决心去寻找传说中涅墨西斯巢穴地，在旅途中赛特不断的遇到新的伙伴与新的强敌不断的成长。
描述主角灯荒仁在机缘巧合下，碰到了过去的好友浅观音真宝，但却因此卷入了一场强者间斗争的故事。
